为定量评价这些翻译元件,团队使用超折叠绿色荧光蛋白(sfGFP)作为报告系统,只有当相应qtRNA成功完成四碱基解码、使后续序列恢复正确阅读框时,细胞才能产生完整的绿色荧光蛋白,因此荧光强度可以直观反映解码效率。利用这一体系,团队不仅验证了多个qtRNA的活性与正交性,还实现了在同一个sfGFP分子中解码四种不同的四联体密码子。另外,四联体密码子下游紧邻的高使用频率密码子有利于正确解码;相反,质粒中某些可能与qtRNA发生竞争的三联体密码子会造成非目标移码。基于这一规律,团队提出了质粒水平的“密码子压缩”策略,在不改造宿主基因组、也不更换天然核糖体的情况下,提高遗传密码扩展(GCE)的效率、稳定性与产物纯度。
在此基础上,优化后的GCE体系可以与分裂内含肽介导的多肽及蛋白质环化技术(SICLOPPS)相结合在大肠杆菌中合成了超过100种自然界中不存在的大环肽,部分分子可同时携带三种不同的非天然氨基酸。这一成果将四联体密码子转化为可编程分子制造工具,为构建多样化大环肽库和发现新型药物先导分子提供了新路径。
报告最后,Badran教授展望了该技术在活性大环分子筛选、主链修饰单体引入和高阶环状结构构建等方面的应用前景,为新型蛋白质、多肽药物及其他“超越自然”的功能分子创制提供了新的可能。